60周年校庆标志以“60”为核心创意，辅以建校、校庆年份“1953-2013”，并融合浪花、彩虹、五星、船舵、校标等主要元素，表达了哈尔滨工程大学校庆60周年的主题和精神内涵。数字“60”鲜明体现了哈尔滨工程大学喜迎建校60华诞的主题；数字“6”似飞舞的浪花，绚烂夺目、波澜壮阔，体现了哈尔滨工程大学60年办学的光辉历程，寓意学校乘风破浪、勇往直前、不断开拓创新的精神品质；数字“0”为五星、彩虹、船舵的巧妙结合，体现了哈尔滨工程大学忠诚、坚韧的精神品质，继承发扬“哈军工”优良传统，服务国家工业化、信息化和国防现代化的坚定信念，坚持“三海一核”（船舶工业、海军装备、海洋工程、核能应用）办学方略的特色发展理念；数字“0”中间为哈尔滨工程大学校标，点明主题。